Minęły 32 lata od pierwszego pokonania Najeźdźców. A.E.G.I.S zostało niemal całkowicie rozwiązane i zmieniło się w podziemną organizację złożoną z zaledwie kilku Gate Keeperów, którzy pozostali, by ocalić ludzkość. Jedna z członkiń, Ayane Isuzu, ma dość społeczeństwa w ogóle, choć nadal pokonuje Najeźdźców na złość ojcu. Nagle dowiaduje się o powrocie Generała Maszyn (Kikai Shogun) i Diabelskiego Hrabiego (Akuma Hakushaku), lecz teraz towarzyszy im tajemnicza dziewczyna-duch. To Ayane i resztki A.E.G.I.S muszą ich powstrzymać i jeszcze raz ocalić ludzkość.
(Źródło: Anime News Network)