W 2010 roku n.e. jednocześnie na całym świecie narodziły się Hiperhuragany, które wyrządziły poważne szkody. Pięć miliardów ludzi straciło życie, a ludność świata zmniejszyła się do 3 miliardów. Dotychczasowe gospodarki i siły zbrojne legły w gruzach. Kraje zamarzły pod warstwą litego lodu, równiny zatonęły pod morzami, a świat zmienił się radykalnie.
Ludzka cywilizacja wkracza w epokę chaosu. Poza tymi strefami ekonomicznymi rozkwitła nędza, a slumsy były powszechne. Członkowie klasy rządzącej nazwali się Logos i siłą oręża utrzymywali swoją pozycję. Biednych nazywają Revenus i wyganiają ich, by żyli poza specjalnymi obszarami ekonomicznymi.
Pokaż cały opis
Od tamtej pory upłynął pewien czas. Katsuragi Jo i Tsurasawa Jin uciekają z Phantom, formacji zorganizowanej do pilnowania Revenus i tłumienia renegackich elementów Logos, zabierając ze sobą tajemniczą dziewczynę, Noto Sanę. Wielu się nią interesuje, a każdy ma ku temu własne powody.