Jadąc pewnego dnia autobusem, Sakurakouji Sakura wygląda przez okno i widzi ludzi palonych żywcem niebieskim ogniem oraz stojącego nad nimi nietkniętego chłopaka w jej wieku.
Następnego dnia wraca na to miejsce, ale nie ma tam ani zwłok, ani jakichkolwiek śladów morderstwa, tylko niewielki ogień. Potem idzie na lekcję i odkrywa, że do klasy przeniósł się nowy uczeń, Oogami Rei, który wygląda dokładnie jak chłopak, którego widziała wcześniej, i nosi czarną rękawiczkę tylko na lewej dłoni.
Oogami jest Code Breakerem, kimś, kto „nie istnieje”. To z pozoru zimnokrwisty zabójca, który kieruje się zasadą „oko za oko”, by „używać zła przeciw złu”. Przekonana, że zabijanie nie jest słuszne, Sakurakouji postanawia go powstrzymać i przeniknąć jego lodowate serce.