Dziesięć lat po klęsce poniesionej w Czwartej Wojnie o Święty Graal Waver Velvet, obecnie Lord El Melloi II, prowadzi zajęcia w Wieży Zegarowej, centrum kształcenia magów. Z nowym statusem „Lord” wiąże się jednak pewien warunek: musi słuchać rozkazów Reines, młodszej siostry zmarłego Kaynetha El Melloi, dopóki ta nie dorośnie na tyle, by objąć rządy nad Rodem El Melloi.
Waver wraz z tajemniczą uczennicą Gray podejmuje się serii spraw zleconych przez Reines i Stowarzyszenie Magów. W miarę jak każda kolejna sprawa okazuje się bardziej złożona od poprzedniej, czy Wieża Zegarowa kryje w sobie więcej, niż mogłoby się wydawać, i jakie tajemnice skrywa Reines?