Sidonia no Kishi: Ai Tsumugu Hoshi

Po zniszczeniu Ziemi przez tajemnicze obce formy życia zwane Gauna ocalałe niedobitki ludzkości uciekły w kosmos na ogromnym statku pokoleń Sidonia. Po tysiącleciach dryfu przez przestrzeń Sidonia znów znalazła się pod atakiem Gauna, po raz pierwszy od stu lat.

Gdy ludzkość po raz kolejny stanęła w obliczu groźby wyginięcia, dzięki Tsumugi Shiraui, hybrydzie człowieka i Gauna, oraz Nagate Tanikaze, asowi pilotów mechów Guardian, z trudem wywalczyła tymczasowe zwycięstwo nad Gauna.

10 lat później... Mieszkańcy Sidonii cieszą się krótkim wytchnieniem. Mijają spokojne dni, podczas których Tsumugi zaczyna uświadamiać sobie swoje uczucia do Nagate, sławionego teraz jako bohatera Sidonii. Jednak, jak kapitan Kobayashi wiedziała od zawsze, dopóki Gauna pozostają, pokój nie może trwać.